- f -

• F : ari_decoder
• f : bcf_info_t
• fc : ari_decoder
• fd : cram_decode_job , cram_job , hFILE_fd , knetFile_s
• feature : cram_record
• features : cram_slice
• file : _bcf_sr_regions_t , _bcf_sweep_t , bcf_sr_t
• file_def : cram_fd
• file_id : cram_file_def
• file_size : knetFile_s
• filter_ids : bcf_sr_t
• finished : __hts_idx_t , hts_itr_t , ks_tokaux_t
• first_base : cram_container , cram_fd
• first_container : cram_fd
• flag : bam1_core_t
• flags : cram_record
• flow_order : gamgee::ReadGroup
• flt : bcf_dec_t
• flush : hFILE_backend
• flush_pos : mFILE
• fmt : __hts_idx_t , bcf_dec_t , hts_cram_idx_t
• fn : htsFile , ref_entry , refs_t
• fn_aux : htsFile
• fname : _bcf_sr_regions_t , bcf_sr_t
• format : htsFile , htsFormat
• fp : _bcf_sweep_t , BGZF , cram_fd , htsFile , mFILE , refs_t , zfp
• free : _regidx_t , cram_codec , pool_alloc_t
• freq : RansDecSymbol
• freqs : cram_stats
• full_c : t_pool
• func : t_pool_job