- r -

• R : ari_decoder
• range : cram_fd
• rans0_cnt : cram_metrics
• rans0_extra : cram_metrics
• rans1_cnt : cram_metrics
• rans1_extra : cram_metrics
• rcp_freq : RansEncSymbol
• rcp_shift : RansEncSymbol
• read : hFILE_backend
• read_names_included : cram_block_compression_hdr
• read_rest : hts_itr_t
• readers : bcf_srs_t
• readrec : hts_itr_t
• rec : _bcf_sweep_t
• rec_encoding_map : cram_block_compression_hdr
• record_counter : cram_block_slice_hdr , cram_container , cram_fd
• ref : cram_container , cram_fd , cram_slice , SAM_hdr
• ref_base_id : cram_block_slice_hdr
• ref_end : cram_container , cram_fd , cram_slice
• ref_fn : cram_fd
• ref_free : cram_fd
• ref_id : cram_container , cram_fd , cram_record , cram_slice , refs_t
• ref_lock : cram_fd
• ref_seq_id : cram_block_compression_hdr , cram_block_slice_hdr , cram_container
• ref_seq_span : cram_block_compression_hdr , cram_block_slice_hdr , cram_container
• ref_seq_start : cram_block_compression_hdr , cram_block_slice_hdr , cram_container
• ref_start : cram_container , cram_fd , cram_slice
• refid : cram_index , cram_range
• refs : cram_fd
• refs_used : cram_container
• reg : regitr_t
• regions : bcf_srs_t
• regs : _bcf_sr_regions_t , _region_t , reglist_t
• require_index : bcf_srs_t
• required_fields : cram_fd
• response : knetFile_s
• result_avail_c : t_results_queue
• result_head : t_results_queue
• result_m : t_results_queue
• result_tail : t_results_queue
• retr : knetFile_s
• revised_method : cram_metrics
• rg : cram_record , SAM_hdr
• rid : bcf1_t
• rid_prev : _regidx_t
• right : ks_isort_stack_t
• rlen : bcf1_t
• rqueue : cram_fd