- a -

• a : hts_itr_t , MD5_CTX
• aend : cram_record
• afeatures : cram_slice
• all_intervals : gamgee::IndexedVariantIterator
• allele : bcf_dec_t
• alloc : cram_block
• alloced : mFILE
• als : _bcf_sr_regions_t , bcf_dec_t
• als_str : _bcf_sr_regions_t
• als_type : _bcf_sr_regions_t
• AP_delta : cram_block_compression_hdr
• apos : cram_record
• apply_filters : bcf_srs_t
• arg : t_pool_job
• at_eof : hFILE
• aTN : cram_slice
• aux : bam_pileup1_t , cram_record
• aux_BD_blk : cram_slice
• aux_BI_blk : cram_slice
• aux_blk : cram_slice
• aux_BQ_blk : cram_slice
• aux_FZ_blk : cram_slice
• aux_oq_blk : cram_slice
• aux_OQ_blk : cram_slice
• aux_os_blk : cram_slice
• aux_oz_blk : cram_slice
• aux_size : cram_record