Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- a -

• allele_count() : gamgee::utils
• allele_key() : gamgee::utils
• allele_key_to_string() : gamgee::utils
• allele_keys() : gamgee::utils
• allele_missing() : gamgee::utils
• allele_strings() : gamgee::utils
• AlleleMask : gamgee
• AlleleType : gamgee

- b -

• Base : gamgee
• bcf_check_equal_element() : gamgee::utils
• bcf_check_equal_element< float >() : gamgee::utils
• bcf_is_vector_end_value() : gamgee::utils
• bcf_is_vector_end_value< float >() : gamgee::utils
• bcf_is_vector_end_value< int32_t >() : gamgee::utils
• bcf_type_sizes : gamgee::utils
• bcf_type_to_element_size() : gamgee::utils

- c -

• cache_and_advance_to_end_if_necessary() : gamgee::utils
• check_max_boundary() : gamgee::utils
• CigarElement : gamgee
• CigarOperator : gamgee
• CombineAllelesLUT : gamgee::utils
• complement() : gamgee::utils
• complement_base() : gamgee::utils
• convert_data_to_float() : gamgee::utils
• convert_data_to_integer() : gamgee::utils
• convert_data_to_string() : gamgee::utils

- d -

• DiploidPLGenotype : gamgee

- e -

• encoded_size() : gamgee::utils

- f -

• FieldOrderedVariantHeaderMerger : gamgee

- h -

• hts_string_array_to_vector() : gamgee::utils
• htslib_filter_name() : gamgee::utils

- i -

• IndexedSingleSamReader : gamgee
• initialize_htslib_buffer() : gamgee::utils
• InputOrderedVariantHeaderMerger : gamgee
• int16 : gamgee::missing_values
• int32 : gamgee::missing_values
• int8 : gamgee::missing_values
• int_encoded_size() : gamgee::utils
• int_encoded_type() : gamgee::utils
• is_string_type() : gamgee::utils

- m -

• make_shared_hts_file() : gamgee::utils
• make_shared_hts_index() : gamgee::utils
• make_shared_hts_itr() : gamgee::utils
• make_shared_ifstream() : gamgee::utils
• make_shared_sam() : gamgee::utils
• make_shared_sam_header() : gamgee::utils
• make_shared_synced_variant_reader() : gamgee::utils
• make_shared_variant() : gamgee::utils
• make_shared_variant_header() : gamgee::utils
• make_unique_hts_file() : gamgee::utils
• make_unique_hts_itr() : gamgee::utils
• MATE_CIGAR_TAG : gamgee
• merge_variant_headers() : gamgee
• missing() : gamgee

- p -

• PairSamReader : gamgee
• parse_interval_record() : gamgee
• PICARD_HEADER_TAG : gamgee

- r -

• read_intervals() : gamgee
• reverse_complement() : gamgee::utils

- s -

• sam_deep_copy() : gamgee::utils
• sam_header_deep_copy() : gamgee::utils
• sam_shallow_copy() : gamgee::utils
• sep : gamgee
• SharedFieldIndex : gamgee
• SingleSamReader : gamgee
• SingleVariantReader : gamgee
• size_for_type() : gamgee::utils
• skip_picard_header() : gamgee
• string_dot : gamgee::missing_values
• string_empty : gamgee::missing_values
• subset_variant_samples() : gamgee

- v -

• variant_deep_copy() : gamgee::utils
• variant_header_deep_copy() : gamgee::utils
• VariantFieldType : gamgee::utils
• VariantIndexPair : gamgee
• VariantIteratorIndexPair : gamgee

- z -

• zip() : gamgee::utils