picard.cmdline

Interfaces

• CommandLineParser.ClpEnum
• CommandLineProgramGroup

Classes

• ClassFinder
• CommandLineDefaults
• CommandLineParser
• CommandLineParser.OptionDefinition
• CommandLineParser.OptionDefinitionByPrintOrderComparator
• CommandLineProgram
• CreateHtmlDocForProgram
• CreateHtmlDocForStandardOptions
• PicardCommandLine
• StandardOptionDefinitions

Exceptions

• CommandLineParseException
• CommandLineParserDefinitionException

Annotation Types

• CommandLineProgramProperties
• NestedOptions
• Option
• PositionalArguments